MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	ATTT	2	8	16	23	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020050	CAAC	2	8	47	54	50 %	0 %	0 %	50 %	436669980
3	NC_020050	TCAGCA	2	12	124	135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436669980
4	NC_020050	AGGA	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
5	NC_020050	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669980
6	NC_020050	TCA	2	6	249	254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
7	NC_020050	AG	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
8	NC_020050	GCT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
9	NC_020050	TGA	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
10	NC_020050	AT	3	6	364	369	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
11	NC_020050	GTT	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669980
12	NC_020050	A	8	8	450	457	100 %	0 %	0 %	0 %	436669980
13	NC_020050	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
14	NC_020050	GAA	2	6	605	610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
15	NC_020050	CGC	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
16	NC_020050	TCG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
17	NC_020050	AGCGC	2	10	709	718	20 %	0 %	40 %	40 %	436669980
18	NC_020050	GTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
19	NC_020050	GCCG	2	8	761	768	0 %	0 %	50 %	50 %	436669980
20	NC_020050	GAG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
21	NC_020050	GAA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
22	NC_020050	AAG	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
23	NC_020050	GATG	2	8	949	956	25 %	25 %	50 %	0 %	436669980
24	NC_020050	TGCT	2	8	978	985	0 %	50 %	25 %	25 %	436669980
25	NC_020050	CCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669980
26	NC_020050	CGT	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
27	NC_020050	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
28	NC_020050	TAG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
29	NC_020050	AT	3	6	1210	1215	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
30	NC_020050	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
31	NC_020050	CTAAA	2	10	1269	1278	60 %	20 %	0 %	20 %	436669980
32	NC_020050	AGA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
33	NC_020050	ATCG	2	8	1316	1323	25 %	25 %	25 %	25 %	436669980
34	NC_020050	ACAG	2	8	1370	1377	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
35	NC_020050	AG	3	6	1385	1390	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
36	NC_020050	GA	4	8	1406	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
37	NC_020050	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
38	NC_020050	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
39	NC_020050	AGA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
40	NC_020050	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
41	NC_020050	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
42	NC_020050	AGG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
43	NC_020050	GAA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
44	NC_020050	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
45	NC_020050	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
46	NC_020050	GAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
47	NC_020050	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
48	NC_020050	AAT	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669980
49	NC_020050	TTC	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669980
50	NC_020050	CGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
51	NC_020050	ACGA	2	8	2637	2644	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
52	NC_020050	GA	3	6	2708	2713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020050	TC	3	6	2744	2749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020050	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
55	NC_020050	CTG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
56	NC_020050	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
57	NC_020050	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669981
58	NC_020050	TAG	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
59	NC_020050	TGG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669981
60	NC_020050	TTG	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669981
61	NC_020050	TGC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
62	NC_020050	CT	4	8	3074	3081	0 %	50 %	0 %	50 %	436669981
63	NC_020050	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669981
64	NC_020050	TAT	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
65	NC_020050	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	436669981
66	NC_020050	GAT	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
67	NC_020050	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669981
68	NC_020050	AATTA	2	10	3553	3562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020050	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020050	TCA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020050	AAG	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020050	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020050	CACC	2	8	3780	3787	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_020050	GGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020050	T	6	6	4041	4046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020050	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669982
77	NC_020050	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669982
78	NC_020050	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669982
79	NC_020050	CTT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669982
80	NC_020050	T	6	6	4251	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	436669982
81	NC_020050	CCAG	2	8	4307	4314	25 %	0 %	25 %	50 %	436669982
82	NC_020050	CATC	2	8	4335	4342	25 %	25 %	0 %	50 %	436669982
83	NC_020050	AAC	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020050	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020050	A	6	6	4418	4423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020050	GAT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020050	TTAT	2	8	4430	4437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020050	AGA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020050	GA	3	6	4465	4470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020050	AGA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020050	CCAG	2	8	4571	4578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020050	A	6	6	4583	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020050	TGG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020050	GCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020050	ATT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020050	A	6	6	4671	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020050	TCA	3	9	4697	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020050	CCA	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020050	A	6	6	4735	4740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020050	A	7	7	4751	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020050	AGA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020050	CAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020050	AGA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020050	TAG	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020050	ACC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020050	TAC	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020050	AGA	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020050	AGT	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020050	TAG	2	6	5058	5063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020050	GAGTG	2	10	5071	5080	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020050	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020050	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020050	TCG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020050	GTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020050	T	6	6	5335	5340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020050	ACG	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020050	ACA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020050	GTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020050	CATC	2	8	5639	5646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020050	A	6	6	5693	5698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020050	GTC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020050	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020050	GTG	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020050	CTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020050	CTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020050	TGA	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020050	TTG	2	6	6032	6037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020050	GTT	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020050	TCT	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020050	T	7	7	6111	6117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020050	TTA	2	6	6122	6127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020050	TGG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020050	CTA	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020050	TGATT	2	10	6180	6189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020050	A	6	6	6212	6217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020050	GAT	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020050	TCT	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020050	GA	3	6	6296	6301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020050	GCA	2	6	6387	6392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020050	ATG	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020050	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020050	CTGC	2	8	6437	6444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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260	NC_020050	T	8	8	12168	12175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_020050	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_020050	ATG	2	6	12586	12591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_020050	AGA	2	6	12735	12740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020050	CAA	2	6	12784	12789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_020050	CTG	2	6	12820	12825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_020050	TCC	2	6	13109	13114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436669989
280	NC_020050	CTT	2	6	13132	13137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669989
281	NC_020050	CTT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669989
282	NC_020050	CTG	2	6	13176	13181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
283	NC_020050	T	6	6	13261	13266	0 %	100 %	0 %	0 %	436669990
284	NC_020050	TAA	2	6	13299	13304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669990
285	NC_020050	CGT	2	6	13489	13494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
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287	NC_020050	CA	3	6	13545	13550	50 %	0 %	0 %	50 %	436669990
288	NC_020050	TTG	2	6	13553	13558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
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290	NC_020050	TGT	2	6	13643	13648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
291	NC_020050	AAT	2	6	13653	13658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669990
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293	NC_020050	TAG	2	6	13727	13732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
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301	NC_020050	TA	3	6	14185	14190	50 %	50 %	0 %	0 %	436669990
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312	NC_020050	TGA	2	6	14715	14720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
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331	NC_020050	T	6	6	15750	15755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_020050	ATT	2	6	15799	15804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_020050	GATT	2	8	16531	16538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_020050	AT	3	6	16915	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_020050	AGC	2	6	17031	17036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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355	NC_020050	T	6	6	17142	17147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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